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O diagrama do mapa conceitual pode ter uma organização hierárquica contendo na parte superior os conceitos mais gerais e inclusivos, seguido, na parte inferior, dos conceitos mais específicos.
Podem ser utilizadas setas para dar sentido de direção a determinadas relações conceituais.
O importante é entender que não existe uma única forma de representar o conhecimento ou uma estrutura conceitual, porque cada representação depende da estrutura cognitiva do autor (aluno, professor), a qual reflete a sua forma de perceber e compreender os conceitos e suas relações.
Para saber mais sobre mapas conceituais e aprendizagem significativa, leia o texto: Mapas Conceituais: uma breve revisão, da Professora Lia C. B. Cavellucci.